Едно от богатствата на Зографския манастир е вековната колекция от ръкописи. От години монасите от манастира работят ръка в ръка заедно с научни работници от Софийския университет, за да придадат стойност на тези архиви и да разкрият пред широката публика ценностите на манастира.
В Зографската света обител са запазени повече от 330 самостоятелни архивни единици от певческите ръкописи и певческите ръкописни фрагменти, от които над 230 са славянски, повече от 80 гръцки и 6 влашки, писани на кирилица.
Векове наред Зографският манастир съхранява множество ръкописни и печатни книги. Най-същественото е, че не само ги съхранява, но че тези книги са четени от братството, а може би и от поклонници, че са част от живота на манастира.